“e-Pulse,” yang dihasilkan oleh pikiran dan emosi manusia, digunakan sebagai sumber energi untuk perangkat pendukung AI “Sapotama.” Dari bayang-bayang perkembangan yang luar biasa ini, muncullah monster yang menakutkan. Digimon adalah makhluk hidup yang berevolusi dengan mengonsumsi e-Pulse.
Tomoro Tenma terseret ke dalam pengalaman yang luar biasa setelah bertemu dengan Gekkomon, yang tiba-tiba muncul dari Sapotama-nya. Saat hidup bersama dengan Kyo Sawashiro dan anggota tim pemburu hadiah “Golden Dawn” lainnya, Tomoro memperbaharui tekadnya. Masa depan baru apakah yang akan ditempa oleh manusia dan Digimon?
